David Schlaffke werd in 1978 in Duitsland (Mühlhausen in Thüringen) geboren en volgde daar zijn eerste piano- en orgellessen. Dankzij de traditierijke orgelmuziekcultuur in Midden-Duitsland, deed hij al op jonge leeftijd ervaring op met het spelen op historische orgels. David Schlaffke studeerde kerkmuziek op het conservatorium „Felix Mendelssohn Bartholdy“ in Leipzig (o.a. bij Arvid Gast). Hij vervolgde zijn studie in de orgel-solistenklas van Hans Fagius op het Koninklijk Deens Conservatorium in Kopenhagen, waar hij in 2006 zijn debuutconcert gaf. Verder volgde hij verschillende master-classes, o.a. van Olivier Latry, Michel Bouvard en Ewald Kooiman. Op het Conservatorium van Amsterdam studeerde David Schlaffke in de klavecimbelklas van Menno van Delft.
In 2007 won David Schlaffke de tweede prijs van het orgelconcours „Johann Sebastian Bach“ in Arnstadt en in 2009 de tweede prijs van het orgelconcours „Gottfried-Silbermann“ in Freiberg.
David Schlaffke gaf concerten in Nederland, Duitsland en andere Europese landen (o.a. Erfurter Dom, Thomaskirche Leipzig, Merseburger Orgeltage, Leipziger Bachfest, Riga Domkerk, Kopenhagen Domkerk, Grote Kerk Alkmaar).
Zijn repertoire bestaat uit werken uit bijna alle periodes, maar het zwaartepunt van zijn belangstelling ligt bij de Duitse Barok en de Duitse Romantiek evenals de Franse muziek uit de 19e en 20e eeuw. Naast orgel speelt David ook piano en klavecimbel in diverse kamermuziekensembles, regelmatig met leden van het Koninklijk Concertgebouworkest.
David Schlaffke is organist van de Sloterkerk in Amsterdam, waar hij in 2011 samen met Susanne Jaspers een CD heeft opgenomen met muziek voor viool en orgel. 2016 verscheen op het label querstand een CD met werken van Franz Liszt, J.S. Bach, Richard Wagner en Julius Reubke, opgenomen op het Reubke-Orgel in Niederdorla (Duitsland).